Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPHK1Q9NYA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPHK1Q9NYA1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms