Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA8Q9NY65 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA8Q9NY65 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA8Q9NY65 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA8Q9NY65 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA8Q9NY65 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA8Q9NY65 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA8Q9NY65 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA8Q9NY65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA8Q9NY65 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms