Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PGPEP1Q9NXJ5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PGPEP1Q9NXJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms