Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ASF1BQ9NVP2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ASF1BQ9NVP2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ASF1BQ9NVP2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms