Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
UFSP2Q9NUQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
UFSP2Q9NUQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms