Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LMBRD1Q9NUN5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMBRD1Q9NUN5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMBRD1Q9NUN5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms