Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PDS5BQ9NTI5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC40.94■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PDS5BQ9NTI5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
PDS5BQ9NTI5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC40.8■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1448.5 ms