Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
ZNF275Q9NSD4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZNF275Q9NSD4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZNF275Q9NSD4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms