Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KCNIP2Q9NS61 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP2Q9NS61 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms