Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNRKQ9NRH2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SNRKQ9NRH2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNRKQ9NRH2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNRKQ9NRH2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms