Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC6

SPTBN5, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN5Q9NRC6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SPTBN5Q9NRC6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPTBN5Q9NRC6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPTBN5Q9NRC6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms