Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHST12Q9NRB3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CHST12Q9NRB3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHST12Q9NRB3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHST12Q9NRB3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms