Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF4Q9NR80 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
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