Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSS2Q9NR19 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSS2Q9NR19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms