Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TREM1Q9NP99 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TREM1Q9NP99 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TREM1Q9NP99 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms