Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSU72Q9NP77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSU72Q9NP77 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSU72Q9NP77 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms