Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ARFGAP3Q9NP61 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARFGAP3Q9NP61 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARFGAP3Q9NP61 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms