Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPB41L5Q9HCM4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPB41L5Q9HCM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPB41L5Q9HCM4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms