Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VAT1LQ9HCJ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VAT1LQ9HCJ6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms