Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLSPNQ9HAW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CLSPNQ9HAW4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLSPNQ9HAW4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CLSPNQ9HAW4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms