Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPCSQ9HAB8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPCSQ9HAB8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPCSQ9HAB8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms