Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NHEJ1Q9H9Q4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NHEJ1Q9H9Q4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NHEJ1Q9H9Q4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NHEJ1Q9H9Q4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms