Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q2

COPS7B, COP9 signalosome complex subunit 7b, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7BQ9H9Q2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS7BQ9H9Q2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPS7BQ9H9Q2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPS7BQ9H9Q2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms