Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYNCQ9H7C4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYNCQ9H7C4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYNCQ9H7C4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms