Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WDR55Q9H6Y2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
WDR55Q9H6Y2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
WDR55Q9H6Y2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms