Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLMPQ9H6B4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLMPQ9H6B4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLMPQ9H6B4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms