Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SPRTNQ9H040 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPRTNQ9H040 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPRTNQ9H040 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms