Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K7

STRADB, STE20-related kinase adapter protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBQ9C0K7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRADBQ9C0K7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRADBQ9C0K7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRADBQ9C0K7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 764.9 ms