Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CFAP74Q9C0B2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CFAP74Q9C0B2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CFAP74Q9C0B2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
CFAP74Q9C0B2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CFAP74Q9C0B2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms