Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM7Q9C029 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM7Q9C029 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM7Q9C029 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms