Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM15Q9C019 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM15Q9C019 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM15Q9C019 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms