Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
NLRP1Q9C000 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NLRP1Q9C000 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NLRP1Q9C000 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NLRP1Q9C000 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms