Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM31Q9BZY9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM31Q9BZY9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM31Q9BZY9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM31Q9BZY9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM31Q9BZY9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM31Q9BZY9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM31Q9BZY9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM31Q9BZY9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM31Q9BZY9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM31Q9BZY9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms