Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM55Q9BYV6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM55Q9BYV6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms