Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABARAPL3Q9BY60 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABARAPL3Q9BY60 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms