Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
SCAPERQ9BY12 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SCAPERQ9BY12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SCAPERQ9BY12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCAPERQ9BY12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms