Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms