Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR4Q9BXB1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR4Q9BXB1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR4Q9BXB1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR4Q9BXB1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LGR4Q9BXB1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LGR4Q9BXB1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LGR4Q9BXB1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LGR4Q9BXB1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms