Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPAP1Q9BWH6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RPAP1Q9BWH6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPAP1Q9BWH6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms