Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HIGD2AQ9BW72 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HIGD2AQ9BW72 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms