Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VAMP8Q9BV40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
VAMP8Q9BV40 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms