Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3CQ9BUI4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
POLR3CQ9BUI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
POLR3CQ9BUI4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms