Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM208Q9BTX3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM208Q9BTX3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms