Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC1Q9BTT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC1Q9BTT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC1Q9BTT6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms