Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOK1Q9BRS2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIOK1Q9BRS2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIOK1Q9BRS2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIOK1Q9BRS2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms