Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLSTN3Q9BQT9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLSTN3Q9BQT9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms