Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
BPIFA3Q9BQP9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
BPIFA3Q9BQP9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BPIFA3Q9BQP9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms