Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KCNS3Q9BQ31 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms