Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC38A3Q99624 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC38A3Q99624 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC38A3Q99624 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms