Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT12Q99456 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT12Q99456 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT12Q99456 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms